Como fazer a alteração de cnpj de associação para condominio?

Somos uma associação com CNPJ de um empreendimento de Cohab, e estamos instituindo o condominio, onde temos o regulamento interno e precisamos fazer a troca ou emitir um novo para o condominio, gostaria de saber como funciona e se é prejudicial abrirmos UM SEGUNDO CNPJ para administração do condominio até que seja expedido o habite-se e finalizado o cnpj antigo.