é possivel recorrer judicialmente a decisao da prefeitura de demolir quartos nao legalizados em cob?

compramos nosso apartamento , onde ja morávamos de aluguel havia uns dez anos, ha cinco anos, fizemos uma reforma, mantendo a estrutura conforme encontramos, pois nao era possível fazer nenhum aumento de área pq somente então soubemos que o terraço tratava-se de área comum do prédio, ocasião em que tb viemos a saber que 2 quartos dos 3 quartos não estavam legalizados. Deixamos como estava para esperar um momento melhor p legalizar.Houve uma denuncia e fomos notificados e multados pela prefeitura, estivemos la hj e a fiscal nos disse que pode riamos entrar com processo de legalização , mas que seria indeferido por tratar -se de R1 (área), ela nos aconselhou a pagar a multa e demolir os quartos. Porem esses quartos existem ha mais de 30 anos, antes da instauração da R1, podemos recorrer judicialmente contra a decisão da prefeitura ou somos obrigados a acatar?